违法建筑的确认流程可能会受特殊或例外情况的干扰。以下列举这些特殊情况及其影响：
1、建筑存在严重安全隐患：若违法建筑存在如结构不稳、有坍塌风险等严重安全隐患，可能危及公共安全或他人财产安全，行政机关在确认流程中可能会加快处理，优先采取责令停用、紧急拆除等措施，可不受常规调查、听证等程序时间限制，以快速消除风险。
2、历史遗留违法建筑：对于因历史原因形成、建设时可能未严格遵守现行规划法规但符合特定条件的违法建筑（如特定历史时期的居民自建房），相关部门在确认处理时可能有特殊政策。会综合考虑建筑形成背景、当时法规及当事人居住需求等，处理方式可能倾向于引导补办手续、罚款保留，而非一律拆除，以平衡法律与历史现实。
3、涉及公共利益的违法建筑：若拆除违法建筑关乎重大公共利益（如影响城市基建、公共卫生安全等），行政机关在确认流程中会更注重效率与公共利益保障，作出处理决定时可能优先实现公共利益，在法律范围内权衡调整当事人权益诉求。
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违法建筑确认流程需按法定步骤进行，各阶段要求不同。该流程一般由行政部门主导，具体步骤会因实际情况有所调整。
违法建筑确认流程主要包含行政调查、认定、处理决定及后续救济等环节。
一旦收到建筑涉嫌违法建设的初步线索，行政机关（通常是城乡规划部门或综合执法部门）会启动调查。调查内容包括核实建筑是否取得建设工程规划许可证及是否按许可建设，会通过现场拍照、询问相关人员、调取规划档案等方式收集证据。
调查确认建筑未取得许可或未按许可建设后，行政机关会依据《城乡规划法》等法规进行违法性质认定，区分“尚可采取改正措施消除影响”和“无法采取改正措施消除影响”两种情况。
作出处理决定前，若涉及重大权益影响，行政机关会告知当事人陈述、申辩权，符合条件的还会组织听证。随后依法作出责令停建、限期改正、罚款、限期拆除等决定，并送达当事人。
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违法建筑确认程序中存在一些法律风险点，可能对相关权益造成损害。以下是这些风险点及实例：
1、行政处罚决定执行风险：行政机关作出限期拆除等处罚决定后，若当事人在法定期限内未申请复议或起诉，且拒不履行，行政机关可依法强制执行，导致建筑被拆除。例如，某业主建筑被认定为违法建筑，行政机关作出15天限期拆除决定，业主在6个月内未提起行政诉讼也未自行拆除，到期后行政机关申请法院强制执行，建筑被拆除。
2、财产损失风险：违法建筑被确认后，当事人可能面临罚款、拆除费用等经济损失。比如，某公司未许可建设厂房，被城乡规划部门认定违法，除被责令限期拆除外，还被处以建设工程造价8%的罚款，同时拆除厂房的费用也需由该公司承担，造成较大财产损失。
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违法建筑确认程序的法律依据主要来自《中华人民共和国城乡规划法》。该法明确了违法建筑的认定主体和处理标准，为确认流程提供了法律基础。
《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条规定：“未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设；尚可采取改正措施消除对规划实施的影响的，限期改正，处建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款；无法采取改正措施消除影响的，限期拆除，不能拆除的，没收实物或者违法收入，可以并处建设工程造价百分之十以下的罚款。”
此条款首先明确了认定主体为“县级以上地方人民政府城乡规划主管部门”，确定了确认流程的启动和主导机关；其次规定了认定违法建筑的核心标准——“未取得建设工程规划许可证”或“未按许可建设”，这是行政机关调查认定的关键依据；最后根据建筑能否改正消除影响，规定了不同处理方式，是后续处理决定的法律依据。因此，违法建筑确认程序需严格遵循该条款的主体、标准和处理方式，确保每一步合法。

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